Музей открыт в мае 1970 г. Его основателем и директором с 1970 до 2007 г. был Магомедов Нурмагомед Магомедович. По свидетельству сельчан, музей начинался с домашней коллекции, и он стал делом всей его жизни.
21 апреля 1977 г. за большую поисково-исследовательскую работу музею был присвоен статус «Школьного музея», затем «Отличный школьный музей», «Краеведческий музей», «Народный музей», «Комплексно-краеведческий музей». После смерти Магомедова Н.М. музей назван его именем – «Юхаристальский комплексно-краеведческий школьный музей имени Магомедова Нурмагомеда Магомедовича».
Музей посетило более 30000 организованных экскурсий. Среди посетителей – известные писатели и политики, ученые, учителя и уча¬щиеся самых различных школ Дагестана. Музей не раз принимал гостей из Германии, Вьетнама, Норвегии, Франции, Ирана, Пакистана.
На сентябрь 2002 года музей насчитывал в своих фондах около 4500 экспонатов.
После пожара 2004 года музей практически перестал работать, и его экспонаты оказались в заброшенном малогабаритном складском помещении.
Ситуация изменилась с вмешательством в дело руководства района, которое осуществило ремонт помещения, ранее являвшегося спортзалом и отдала его под музей. С января 2007 года музей включен в бюджет Сулейман-Стальского района. Назначен новый директор. Им стал уроженец селения Юхаристал, кандидат физико-математических наук Авчиев Исламудин Абдулагаевич. Музею выделены финансовые средства для приобретения необходимой мебели. Была произведена полная инвентаризация и фотографирование всех сохранившихся экспонатов без ранжирования их ценности, и они размещены в музее по структурным разделам. Вся информация приведена в цифровой формат. Для удобства поиска нужного экспоната каждому из них присвоен маркировочный символ в пределах его структурного раздела с номе¬ром его позиции. Среди ценностей музея палеонтологические находки, предметы гончарного производства, медные изделия, оружие и т.д. Например, наиболее интересным экспонатом палеонтологического отдела является зуб мамонта весом более 1 кг. В археологическом отделе представлены кремниевые наконечники стрел и скребки, бронзовые кольца, серьги, пояса, фрагменты серой керамики албанского периода. Нумизматический отдел содержит коллекции металлических монет и денежных знаков, среди которых медяки дербентских ханов, серебряные и медные монеты русских князей 17-18 вв., турецкие, персидские и монгольские денежные знаки.
На базе музея организуются краеведческие кружки, в том числе и ТОКС.
